2005年9月19日-21日，“三峡库区及其上游水污染防治战略咨询”项目研讨会在重庆召开。会议由魏复盛院士主持，中国工程院副院长沈国舫、国家环保总局副局长汪纪戎，金鉴明、张懿、何继善、蔡道基等院士，课题组部分专家及四川省、重庆市、宜昌市发改委、经委、环保局、水利局等14个相关部门的负责人共计70余人参加了会议。
　　重庆市副市长赵公卿到会欢迎院士、专家来渝，并对重庆市三峡库区水污染防治工作的进展及当前面临的主要问题做了详细的介绍。之后项目负责人魏复盛、沈国舫相继向大会通报了项目的简要实施方案及总体研究进展。汪纪戎介绍了《三峡库区及其上游水污染防治规划（2001～2010年）》“十五”期间实施进展情况和“十一五”目标及方案，并高度肯定了本项目的战略意义，同时对项目实施方案提出了诸多细化性建议。
　　四川省、重庆市、宜昌市相关部门负责人分别汇报了三峡库区及其上游影响区的工业污染、河流污染、农业面源污染、船舶水污染的防治工作情况。根据规划要求，在国家各部委的大力支持下，四川、重庆、湖北在三峡库区水污染防治工作中取得了积极进展，但由于经济水平不高、库区特殊地质条件限制以及技术能力等原因，全面推进水污染防治规划仍然面临诸多问题，包括配套设施建设相对滞后、小城镇污水垃圾项目建设成本过高、消落区生态环境问题、缺乏流域统一协调监督管理机制等，同时迫切建议在下阶段围绕水污染防治所做的主要工作应集中在建立完善的社会补偿和流域环境保护统一协调管理机制、开展技术创新和机制创新、加快发展循环经济、提高资源利用效率等方面。
　　项目组8个课题组也分别从三峡库区及其上游污染物排放总量调查、水质变化趋势、面源污染控制对策、水污染防治技术与政策、小流域综合整治、经济快速发展与污染物排放零增长的可行性研究、流动污染源防治对策、水质保护管理体系及其流域协调发展等方面的阶段性研究成果进行了汇报。
　　与会代表就上述汇报内容展开了热烈的讨论，指出：省市政府部门、相关单位工作在三峡库区水污染防治的第一线，掌握了大量详细真实的数据资料，为项目提供了翔实的研究基础，对本项目的不断完善和提高具有重要意义。此次会议加强了项目组与地方政府部门的联系，为项目工作的下一步顺利开展提供了良好契机。同时，代表们也为课题组研究内容的充实、项目完成时间等方面提出了一些意见，希望课题组和地方部门之间加强交流，完成一个高水平的咨询报告，从实际出发，为三峡库区及其上游水污染防治工作提供切实可行的指导性决策。
　　最后，魏复盛院士要求各课题组根据会议精神，认真总结相关建议，进一步调整和完善实施方案，以便更好开展下步工作。