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邓秀新:中国首个果树基因组序列图谱在华中农大完成测序

来源:新华网(社会频道)   发表时间:2012-03-26

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华中农业大学21日对外公布了甜橙全基因组序列图谱。华中农大的园艺学、基因组学、生物信息学科研人员经过一年多的努力,破解了甜橙基因“密码”,完成了甜橙基因组拼接与注释,获得了较高质量的甜橙基因组。
  据了解,这是中国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱,也是世界上目前最为完整的甜橙全基因组序列图谱。
  课题牵头人、中国工程院院士、华中农业大学邓秀新教授说:“中国作为柑橘栽培、生产的第一大国,甜橙全基因组序列图谱绘制完成,标志着中国在生物技术和功能基因组合上搭建起一个很好的科研平台,也对促进柑橘的品种改良,全面提升产业竞争力具有重要意义。”
  中国是世界上重要的柑橘原生中心,柑橘栽培历史可追溯到4000年前。根据中国农业部公布的数据,2010年中国总产量2645万吨,种植面积为221万公顷,是世界柑橘第一生产大国。
  邓秀新院士说,中国虽然是柑橘生产的第一大国,但目前栽培的柑橘品80多个品种中有40%来自国外,而柑橘产量的50%也是由国外品种产生。中国需要在柑橘基因技术的基础研究取得突破,加快品种改良步伐,从而提升产业的核心竞争力。
  华中农业大学此次甜橙基因组测序采用全基因组鸟枪法(WGS)策略,进行双末端测序,得到数据总量约为200G,拼接后的序列覆盖87%的柑橘基因组,获得注释的基因近3万个。
  邓秀新说,甜橙基因组序列图谱的完成,如同打开了甜橙生命活动的“黑匣子”,破解了甜橙基因“密码”,得到了基因组合的排列顺序和相关特征。这为今后研究中有意识地锁定甜橙成熟期、色泽、含糖量、产量、抗病性等农艺性状提供了良好的基础,有利于培养出更好、更健康的品种来。
  此次甜橙全基因组序列图谱使中国在柑橘基因的基础研究上与国际先进水平接轨。“我们在有些领域的研究上还有中国自己的特点。”邓秀新说,“这为中国将来的生物技术发展提供更好的基础,也有利于提升中国柑橘研究的国际地位。”
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